Skip to content

Spp 002 nl#157

Open
karenwuyts wants to merge 30 commits into
mainfrom
spp-002-nl
Open

Spp 002 nl#157
karenwuyts wants to merge 30 commits into
mainfrom
spp-002-nl

Conversation

@karenwuyts

@karenwuyts karenwuyts commented Apr 28, 2026

Copy link
Copy Markdown

Description

Project-specific protocol on the location evaluation and local replacement of sample units in terrestrial habitat types, for the Monitoring Programme for the Natural Environment (Meetnetten Natuurlijk Milieu, MNM).

Related Issue

Task list

Steps by contributor:

  • Add description to this pull request (under "## Description")
  • Open the dropdown (triangle) near 'create pull request' and choose 'Create draft pull request'
  • Check for potential problems by running protocolhelper::check_frontmatter() and address them
  • Check for potential problems by running protocolhelper::check_structure() and address them
  • Add further commits if needed and push them to GitHub
  • Update the protocol-specific NEWS.Rmd
  • Mark the pull request as 'ready for review'

Review steps for the author(s):

  • Add reviewers, at least one subject-matter specialist and one administrator
  • Wait for review comments and address them
  • Iterate until reviewer approvals (merging the pull request will be done by an administrator)
  • Verify that the checks done by continuous integration succeeded. These will check if protocolhelper::check_frontmatter() and protocolhelper::check_structure() succeeded without errors.

To be done by an administrator after review: see guidelines for admins.

karenwuyts and others added 25 commits July 4, 2025 18:47
This manually solves the effect of issue inbo/protocolhelper#133 in the
spp_002_nl branch, which isn't yet part of a pull request.
spp-002-nl: fix _bookdown.yml output dir
@karenwuyts karenwuyts marked this pull request as draft April 28, 2026 09:30
@karenwuyts karenwuyts marked this pull request as ready for review April 28, 2026 09:32
@karenwuyts karenwuyts requested a review from janneadolf April 28, 2026 09:33
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/02_onderwerp.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/02_onderwerp.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/04_werkwijze.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/04_werkwijze.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/04_werkwijze.Rmd Outdated
Eens je je in de nabijheid van de meetlocatie bevindt (vb. op 10 m), navigeer je met behulp van de RTK-GPS-ontvanger naar de exacte locatie van het centrum van de steekproefeenheid.

**Let op**: in de rastercel kan een permanent kwadraat van het meetnet biotische habitatkwaliteit aanwezig zijn.
Het is 3 m op 3 m groot en bevindt zich ten noordwesten van het celmidden: het celmidden van de rastercel is het zuidoostelijk hoekpunt van het permanent kwadraat.

Copy link
Copy Markdown
Contributor

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

figuurtje toevoegen

Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/04_werkwijze.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/04_werkwijze.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/04_werkwijze.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/04_werkwijze.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/04_werkwijze.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/04_werkwijze.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/04_werkwijze.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/04_werkwijze.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/04_werkwijze.Rmd Outdated
Blijkt dat de steekproefeenheid of zijn vervangeenheid **het doeltype bevat**, dan voer je aansluitend een celkartering en markering uit.
De celkartering houdt in dat je ter plaatse beoordeelt waar het doeltype actueel aanwezig is in de 32 m op 32 m rastercel.

### Plaats een markering

Copy link
Copy Markdown
Contributor

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

suggestie: foto toevoegen

Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/04_werkwijze.Rmd Outdated

@Patrikoosterlynck Patrikoosterlynck left a comment

Copy link
Copy Markdown
Contributor

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

@karenwuyts ik ben er grondig doorgegaan
Over algemeen vind ik de begrippenlijst nogal moeilijk gedefinieerd, maar in het document wordt wel snel duidelijk wat er nu juist bedoeld wordt. Verder zit er in de werkwijze een voor mij onduidelijkheid in de regels (meer/minder dan 50% van de cel bepaald of het effectief een steekproeflocatie wordt...?). Misschien gaat het over die 9m² die men dient te beoordelen ipv de ganse rastercel? Enfin, werkwijze kan wel helderder. Als die stappen in een flowchart steken zou ook wel een meerwaarde zijn denk ik. (verdere opsmuk met wat fotootjes van materialen kan ook nog)

@karenwuyts

Copy link
Copy Markdown
Author

@karenwuyts ik ben er grondig doorgegaan Over algemeen vind ik de begrippenlijst nogal moeilijk gedefinieerd, maar in het document wordt wel snel duidelijk wat er nu juist bedoeld wordt. Verder zit er in de werkwijze een voor mij onduidelijkheid in de regels (meer/minder dan 50% van de cel bepaald of het effectief een steekproeflocatie wordt...?). Misschien gaat het over die 9m² die men dient te beoordelen ipv de ganse rastercel? Enfin, werkwijze kan wel helderder. Als die stappen in een flowchart steken zou ook wel een meerwaarde zijn denk ik. (verdere opsmuk met wat fotootjes van materialen kan ook nog)

Bedankt voor het grondige nalezen @Patrikoosterlynck . Ik bekijk nog met Ward de onduidelijkheid. Goed idee van de flowchart en de foto's.

…p-002-nl

update following the upgrade of R4.5 to R4.6
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/02_onderwerp.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/02_onderwerp.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/02_onderwerp.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/02_onderwerp.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/02_onderwerp.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/02_onderwerp.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/02_onderwerp.Rmd
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/02_onderwerp.Rmd
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/03_benodigdheden.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/04_werkwijze.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/04_werkwijze.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/04_werkwijze.Rmd Outdated
Comment thread source/spp/mnm/spp_002_nl_locatie-eval_mnm/05_kwaliteitszorg.Rmd

@karenwuyts karenwuyts left a comment

Copy link
Copy Markdown
Author

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

suggesties voor behandeling review comments

karenwuyts and others added 3 commits May 22, 2026 09:33
Co-authored-by: Patrikoosterlynck <40395174+Patrikoosterlynck@users.noreply.github.com>

@janneadolf janneadolf left a comment

Copy link
Copy Markdown

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Here my review of the current protocol version.
I hope my feedback proves useful, feel free to ignore it in case it is not.
Let me know if any of my comments are unclear, require further discussion, or if I misunderstood important parts of the protocol.

-->
```

**Celgekoppelde type**: celgebaseerde habitat(sub)type of regionaal belangrijk biotoop waarbij de GRTS-rastercel wordt toegewezen op basis van ruimtelijke overlap van het habitat(sub)type of regionaal belangrijke biotoop met de rastercel, maar het type treft niet noodzakelijk het celmidden van de rastercel (in tegenstelling tot een celmiddengekoppelde type)

Copy link
Copy Markdown

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Suggested change
**Celgekoppelde type**: celgebaseerde habitat(sub)type of regionaal belangrijk biotoop waarbij de GRTS-rastercel wordt toegewezen op basis van ruimtelijke overlap van het habitat(sub)type of regionaal belangrijke biotoop met de rastercel, maar het type treft niet noodzakelijk het celmidden van de rastercel (in tegenstelling tot een celmiddengekoppelde type)
**Celgekoppelde type**: celgebaseerde habitat(sub)type of regionaal belangrijk biotoop waarbij een GRTS-rastercel wordt toegewezen op basis van ruimtelijke overlap van het habitat(sub)type of regionaal belangrijke biotoop met de rastercel, maar het type treft niet noodzakelijk het celmidden van de rastercel (in tegenstelling tot een celmiddengekoppelde type)

-->
```

**Celgekoppelde type**: celgebaseerde habitat(sub)type of regionaal belangrijk biotoop waarbij de GRTS-rastercel wordt toegewezen op basis van ruimtelijke overlap van het habitat(sub)type of regionaal belangrijke biotoop met de rastercel, maar het type treft niet noodzakelijk het celmidden van de rastercel (in tegenstelling tot een celmiddengekoppelde type)

Copy link
Copy Markdown

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Suggested change
**Celgekoppelde type**: celgebaseerde habitat(sub)type of regionaal belangrijk biotoop waarbij de GRTS-rastercel wordt toegewezen op basis van ruimtelijke overlap van het habitat(sub)type of regionaal belangrijke biotoop met de rastercel, maar het type treft niet noodzakelijk het celmidden van de rastercel (in tegenstelling tot een celmiddengekoppelde type)
**Celgekoppelde type**: celgebaseerde habitat(sub)type of regionaal belangrijk biotoop waarbij de GRTS-rastercel wordt toegewezen indien ze ruimtelijk overlapt met het habitat(sub)type of regionaal belangrijke biotoop, maar het type treft niet noodzakelijk het celmidden van de rastercel (in tegenstelling tot een celmiddengekoppelde type)

-->
```

**Celgekoppelde type**: celgebaseerde habitat(sub)type of regionaal belangrijk biotoop waarbij de GRTS-rastercel wordt toegewezen op basis van ruimtelijke overlap van het habitat(sub)type of regionaal belangrijke biotoop met de rastercel, maar het type treft niet noodzakelijk het celmidden van de rastercel (in tegenstelling tot een celmiddengekoppelde type)

Copy link
Copy Markdown

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Suggested change
**Celgekoppelde type**: celgebaseerde habitat(sub)type of regionaal belangrijk biotoop waarbij de GRTS-rastercel wordt toegewezen op basis van ruimtelijke overlap van het habitat(sub)type of regionaal belangrijke biotoop met de rastercel, maar het type treft niet noodzakelijk het celmidden van de rastercel (in tegenstelling tot een celmiddengekoppelde type)
**Celgekoppelde type**: celgebaseerde habitat(sub)type of regionaal belangrijk biotoop waarbij de GRTS-rastercel wordt toegewezen op basis van ruimtelijke overlap van het habitat(sub)type of regionaal belangrijke biotoop met de rastercel. Het type treft hierbij niet noodzakelijk het celmidden van de rastercel (in tegenstelling tot een celmiddengekoppelde type)

**Celgekoppelde type**: celgebaseerde habitat(sub)type of regionaal belangrijk biotoop waarbij de GRTS-rastercel wordt toegewezen op basis van ruimtelijke overlap van het habitat(sub)type of regionaal belangrijke biotoop met de rastercel, maar het type treft niet noodzakelijk het celmidden van de rastercel (in tegenstelling tot een celmiddengekoppelde type)

**Celkartering**: het ruimtelijk in kaart brengen van het voorkomen van het doeltype binnen een rastercel van 32 m op 32 m.
Dit resulteert in een polygoon die uitsluitend uit het doeltype bestaat (en gelegen is binnen de grenzen van de rastercel), ook celkarteringspolygoon genoemd.

Copy link
Copy Markdown

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Suggested change
Dit resulteert in een polygoon die uitsluitend uit het doeltype bestaat (en gelegen is binnen de grenzen van de rastercel), ook celkarteringspolygoon genoemd.
Dit resulteert in een polygoon binnen de grenzen van de rastercel die uitsluitend uit het doeltype bevat, ook celkarteringspolygoon genoemd.

**Celkartering**: het ruimtelijk in kaart brengen van het voorkomen van het doeltype binnen een rastercel van 32 m op 32 m.
Dit resulteert in een polygoon die uitsluitend uit het doeltype bestaat (en gelegen is binnen de grenzen van de rastercel), ook celkarteringspolygoon genoemd.

**Celmiddengekoppelde type**: celgebaseerde habitat(sub)type of regionaal belangrijk biotoop waarbij het midden van een GRTS-rastercel het type treft

Copy link
Copy Markdown

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Suggested change
**Celmiddengekoppelde type**: celgebaseerde habitat(sub)type of regionaal belangrijk biotoop waarbij het midden van een GRTS-rastercel het type treft
**Celmiddengekoppelde type**: celgebaseerde habitat(sub)type of regionaal belangrijk biotoop waarbij een GRTS-rastercel wordt toegewezen indien het midden van de GRTS-rastercel het type treft


Aanvullend op dat protocol geldt voor lokale vervangingen in grote polygonen een extra regel.
In het geval van grote polygonen kan het aflopen en evalueren van de mogelijke vervangeenheden zeer veel moeite en tijd kosten.
Om dit te beperken, worden grote polygonen opgedeeld volgens de met de polygoon overlappende GRTS-level03-cellen van 128 m op 128 m.

Copy link
Copy Markdown

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

"GRTS-level03-cellen" simplify in analogy to the earlier removal of this kind of information?
Something like:
"sets / kwadraten van GRTS rastercellen"/"grotere GRTS rastercellen"...

Aanvullend op dat protocol geldt voor lokale vervangingen in grote polygonen een extra regel.
In het geval van grote polygonen kan het aflopen en evalueren van de mogelijke vervangeenheden zeer veel moeite en tijd kosten.
Om dit te beperken, worden grote polygonen opgedeeld volgens de met de polygoon overlappende GRTS-level03-cellen van 128 m op 128 m.
Enkel die GRTS-level03-cel waarin de originele steekproefeenheid gelegen is (én meer dan ... rastercellen bevat), wordt verder beschouwd.

Copy link
Copy Markdown

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

"..." ?

### Beoordeel het gebied binnen de rastercel en markeer de celkarteringspolygoon

Voer de celkartering uit: teken in de GIS-applicatie met behulp van de RTK-GPS-ontvanger de grenzen van de gebieden in de rastercel waar het doeltype actueel aanwezig is.
Dit kan door de rastercel systematisch te doorlopen (vermijd de zone van het permanent kwadraat) of aan de rand van de rastercel voor zover de gevoeligheid van de vegetatie dit toelaat.

Copy link
Copy Markdown

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Suggested change
Dit kan door de rastercel systematisch te doorlopen (vermijd de zone van het permanent kwadraat) of aan de rand van de rastercel voor zover de gevoeligheid van de vegetatie dit toelaat.
Dit kan door de rastercel systematisch te doorlopen (vermijd de zone van het permanent kwadraat van het meetnet biotische habitatkwaliteit) of aan de rand van de rastercel voor zover de gevoeligheid van de vegetatie dit toelaat.

### Beoordeel het gebied binnen de rastercel en markeer de celkarteringspolygoon

Voer de celkartering uit: teken in de GIS-applicatie met behulp van de RTK-GPS-ontvanger de grenzen van de gebieden in de rastercel waar het doeltype actueel aanwezig is.
Dit kan door de rastercel systematisch te doorlopen (vermijd de zone van het permanent kwadraat) of aan de rand van de rastercel voor zover de gevoeligheid van de vegetatie dit toelaat.

Copy link
Copy Markdown

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

What is meant by "aan de rand van de rastercel"?

Controleer voor je op terrein vertrekt steeds of je alle relevante protocollen, veldsleutels en benodigdheden mee hebt.
Volg de stappen in de GIS-applicatie om er zeker van te zijn dat alle nodige informatie digitaal genoteerd wordt.
Wanneer je tablet of laptop verbonden is met het internet, worden de in de applicatie ingegeven waarden onmiddellijk doorgestuurd naar de server.
Heb je tijdelijk geen connectie, controleer dan zeker bij het afronden van je veldwerk (vb. wanneer je in de wagen stapt voor je wegrijdt) dat de informatie is doorgestuurd naar de server.

Copy link
Copy Markdown

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

How does one know that the information reached the server?

@janneadolf janneadolf left a comment

Copy link
Copy Markdown

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Here my review of the current protocol version.
I hope my feedback proves useful, feel free to ignore it in case it is not.
Let me know if any of my comments are unclear, require further discussion, or if I misunderstood important parts of the protocol.

Sign up for free to join this conversation on GitHub. Already have an account? Sign in to comment

Labels

None yet

Projects

None yet

Development

Successfully merging this pull request may close these issues.

7 participants